原北京大学校长许智宏院士说：“北大的名气是因为她拥有众多优秀的学生，而培养一个优秀的大学生应该从基础教育做起。虽然北大录取了最高考分的学生，但由于基础教育体制存在的问题，从小学到中学，应试教育模式使学生们的内在潜能没有得到很好的开发，这给高等教育带来了许多困惑。我希望北大附属实验学校，能够引进新理念，培养学生综合素质，而不是制造简单的“应试机器”。”2005年，钱老发出著名的钱学森之问“为什么我们的学校总是培养不出杰出人才？”
在北京大学老校长的关怀下，在对“钱学森之问“的思索中，在北大“敢为天下先”进取精神的鞭策下，北大附属实验学校以“传承北大精神，回归教育本真”为办学理念，承载着为中华民族跻身世界强国培养杰出人才的历史使命。
“传承北大精神”是指肩负着将“思想自由、兼容并包、人格独立”的北大精神在嘉兴延伸的责任。奥地利科学家劳伦滋博士发现了著名的关键期理论，并因此获得诺贝尔奖。所谓关键期理论是指：人类的某种行为和技能、知识的掌握，在某个特定的时期发展最快，最容易受环境影响。如果在这个时期施以正确的教育，可以收到事半功倍的效果；而一旦错过这一时期，就需要花费很多倍的努力才能弥补，或者将可能永远无法弥补。“回归教育本真”是指要在合适的时间，学合适的内容，打合适的基础，以避免幼儿园小学化、高中大学化等学段混同的乱象；同时，从人的终身学习发展和幸福的视角来审视基础教育的内容，即是否每个人都得到了适合自己的教育、发展了自身的长处；是否每个人都找到了类似于身心健康、坚毅品格、批判精神的东西，从而真正奠定一个人终身受用的坚实基础。
至今，北大附属实验学校在全国有三十多所学校，集中分布于华北、华东、华南及西南地区，已形成强大的集团化办学规模。
